
したっぱ昆虫細胞研究者のメモ
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はじめまして!
はじめまして! 昆虫に関する論文、細胞に関する論文、培養に関する論文を好んで読んでいます。 人気ブログランキングに参加しています。 本家に追いつけるように、サボらないように頑張りますので応援..(2012/12/31 23:59) コメント(2)
NLTKで論文を読んでみた
今日の材料はこれ Transcriptome Responses of Insect Fat Body Cells to Tissue Culture Environment 映画「The S..(2012/06/03 6:58)
お家でできるMac Bookでやる次世代シーケンスデータ解析
『お家でできるMac Bookでやる次世代シーケンスデータ解析』iPadZineで公開しました。pdf形式になってます。http://www.ipad-zine.com/b/1520 人気ブログ..(2012/03/25 23:35)
オートファジーがアポトーシスを防ぐ
2つの鱗翅目のセルラインの飢餓への対応から、オートファジーの仕事をみた論文 Wu W, Wei W, Ablimit M, Ma Y, Fu T, Liu K, Peng J, Li Y, Ho..(2011/07/12 3:23)
D.m.由来セルラインの発現比較
キイロショウジョウバエのセルラインは生物学的な資源として貴重な存在です。それらが、どのような遺伝子を発現しているのか、著者らはマイクロアレイと次世代シーケンサーを用いて調査しました。 Lucy ..(2011/05/24 2:22)
次世代解析の特に比較に便利なRパッケージ: DEseq
次世代シーケンスデータの解析には、配列情報を扱うものと、それに引き続く数値(発現量とか)を扱う段階がありますが、後者の方はまだあんまり王道がないです(と思ってます)。 mRNA-seqの発現比較..(2011/05/12 5:13)
SRAにハエセルライン45lineのmRNA-seqデータ上がってる!
NCBIが打ち切り表明をしているSRAに、D. melanogaster由来のセルラインのRNA Seqデータが45line分も上がってました! したっぱ歓喜!!w NCBI->SRA->"cel..(2011/05/09 20:07) コメント(1)
ヒト組織をNGSで解析して、そこにいる菌とかを検出するシステム
次世代シーケンサーで発現解析とかやってるときに、なぜかマッピング/アセンブリが上手く行かない。。。 そんなときにあぶれた配列を調べたら、サンプルが汚染されてる証拠が見つかったりします。 なので、次..(2011/05/07 8:18)
バッタ胚セルライン
飛蝗とか問題児なのになかなかセルラインが出来ないバッタさんのセルラインの報告。 実は前にも2つくらいあったけど、どっちも絶えてて今不在だったはず。 Xin Zhang, Ying Feng, ..(2011/05/06 3:38)
エサでメチレーションが変わってスプライシングも変わる:ミツバチ
Frank Lyko, Sylvain Foret, Robert Kucharski, Stephan Wolf, Cassandra Falckenhayn, Ryszard Maleszka ..(2011/05/05 19:33)
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